Je možno využít aplikace MozBackup která navíc umí zálohovat i Thunderbird a další. Aplikaci je nutno instalovat. Dá se ale využít i MozBackup ZIP version (no install) které není nutno instalovat.
Další možností je zálohovat složku s profilem, případně pouze soubor PREFS.JS kam se ukládá nastavení about:config
Konfiguraci naleznete v této cestě
%appdata%\mozilla\firefox\profiles